Algunos virus intentan engañar a software antivirus mediante la interceptación de sus peticiones al sistema operativo. Un virus puede ocultarse mediante la interceptación de solicitar el software antivirus para leer el archivo y pasar la solicitud al virus, en lugar del sistema operativo. El virus se puede volver una versión infectada del archivo para el software antivirus, por lo que parece que el archivo está "limpio". Moderno software antivirus utiliza diferentes técnicas para contrarrestar los mecanismos de ocultación de los virus. El único método totalmente confiable para evitar el sigilo es arrancar desde un medio que se sabe que es limpia.
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